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疫情66天,全球190篇論文解碼新冠病毒

每日經(jīng)濟(jì)新聞 2020-03-04 09:29:39

每經(jīng)記者 蘭素英 余佩穎 文巧 張凌霄    每經(jīng)編輯 蘭素英    

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圖片來源:每經(jīng)制圖

近日,新冠肺炎疫情在全球持續(xù)蔓延。當(dāng)?shù)貢r間2月26日,世衛(wèi)組織總干事譚德塞在日內(nèi)瓦表示,25日中國境外上報(bào)的新冠肺炎新增病例數(shù)首次超過中國境內(nèi)新增病例數(shù),目前意大利、伊朗、韓國的情況令人十分擔(dān)憂。

面對疫情,學(xué)術(shù)界以最快速度加入了這場沒有硝煙的“戰(zhàn)場”?!缎掠⒏裉m醫(yī)學(xué)雜志》(The New England Journal of Medicine)、《柳葉刀》(The Lancet)等世界級著名醫(yī)學(xué)雜志還單獨(dú)為新冠肺炎開設(shè)了專欄。

據(jù)《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者不完全統(tǒng)計(jì),從12月26日至3月1日,來自中國疾病預(yù)防控制中心文獻(xiàn)目錄以及全球權(quán)威醫(yī)學(xué)期刊的各類新冠病毒的研究文章共計(jì)190篇,身在全球抗疫一線的中國醫(yī)學(xué)研究者是發(fā)稿的主要力量,其中115篇出自中國研究團(tuán)隊(duì),占61%。

面對醫(yī)學(xué)界在學(xué)術(shù)領(lǐng)域的積極發(fā)文,國內(nèi)質(zhì)疑聲不斷:在重大公共衛(wèi)生事件面前,是否該著急搶發(fā)論文?究竟是科研重要,還是疫情防控重要?

“疫情防控有兩條主線,一是防控和診治,二是科學(xué)研究。中國工程院副院長、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院院長王辰此前接受采訪時表示。從病毒溯源、病原檢測、基因測序,到藥物試驗(yàn)、疫苗開發(fā),抗“疫”既是人類同病毒的殊死較量,也是科研與疫情的激烈搏斗。

 “科學(xué)及醫(yī)學(xué)研究在理解這一新型冠狀病毒及與之相關(guān)的呼吸系統(tǒng)疾病方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,同時也有助于尋求解決方案以遏制其蔓延。“全球最權(quán)威的學(xué)術(shù)期刊之一《自然》(Nature)的總編輯瑪格達(dá)琳娜·斯凱珀(Magdalena Skipper)在接受《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者采訪時表示。

學(xué)術(shù)抗疫:66天,139篇原創(chuàng)論文

隨著對疫情及病例的不斷研究,國內(nèi)外學(xué)者發(fā)表的關(guān)于新冠病毒的論文也在日益增多。在接受《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者采訪時,頂級醫(yī)學(xué)期刊《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》表示,“鑒于目前的疫情,我們已經(jīng)加快論文發(fā)表的進(jìn)程,從提交到發(fā)布的時間短達(dá)48小時。

打響這場科學(xué)抗疫之戰(zhàn)的第一槍要追溯至1月中上旬。彼時,中國疾控中心、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院以及中國科學(xué)院三方均在掌握到新型冠狀病毒全基因組序列后,向世界衛(wèi)生組織提交了病毒序列,且在全球流感共享數(shù)據(jù)庫(GISAID,Global Initiative on Sharing All Influenza Data)發(fā)布。

自此之后,這一神秘的病毒開始在科學(xué)家的顯微鏡下逐漸顯形。據(jù)《每日經(jīng)濟(jì)新聞》不完全統(tǒng)計(jì),截至3月1日,各類新冠病毒的研究文章共計(jì)190篇。

值得注意的是,這190篇文章并非都屬原創(chuàng)論文,其中有27%的通訊文章和新聞等其他類稿件,而原創(chuàng)論文共計(jì)139篇,占比達(dá)73%。

通常,原創(chuàng)論文的內(nèi)容需包含研究假設(shè)、研究背景、研究方法、研究結(jié)果、研究發(fā)現(xiàn)解釋和討論可能的含義,發(fā)稿要求較高。

在具體的研究方向上,根據(jù)世界衛(wèi)生組織此前劃分的九大重點(diǎn),即新冠病毒的自然史、傳播模式和診斷方法;識別動物宿主;流行病學(xué)研究;臨床特征和管理;疫情防控;候選療法的研發(fā);候選疫苗的研發(fā);倫理評估;應(yīng)對疫情相關(guān)的社會科學(xué)層面諸多問題的潛在驅(qū)動因素來看,以“新冠病毒的自然史,傳播模式和診斷方法”這一研究方向最為熱門,共計(jì)發(fā)稿38篇,占比27%;其次是“流行病學(xué)研究”,發(fā)稿33篇,占比24%;位列第三的是“臨床特征和管理”,發(fā)稿30篇,占比21.6%。

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圖片來源:每經(jīng)制圖

在這一系列研究成果名錄之下,有武漢金銀潭醫(yī)院全球首發(fā)的新冠肺炎患者的臨床研究論文,有香港大學(xué)團(tuán)隊(duì)基于家庭發(fā)病案例研究得出新冠病毒人傳人的事實(shí),有美國華盛頓州衛(wèi)生部公共衛(wèi)生實(shí)驗(yàn)室首發(fā)的在患者糞便中檢測到新冠病毒的研究,還有武漢病毒研究所石正麗團(tuán)隊(duì)和香港大學(xué)管軼團(tuán)隊(duì)在鍥而不舍地追溯新冠病毒的宿主……

“有關(guān)研究及成果預(yù)計(jì)在今年及之后會出現(xiàn)激增,“《自然》總編輯斯凱珀對《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者表示。 

預(yù)印本平臺:科研文獻(xiàn)最快發(fā)布的主戰(zhàn)場

據(jù)《每日經(jīng)濟(jì)新聞》梳理的文章發(fā)布平臺看,除了廣為人知的《柳葉刀》外,bioRxiv和medRxiv的發(fā)稿量最大,合占總稿量的45%。其次是《柳葉刀》,占比23%,隨后是《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》,占5%,《自然》排名第四,占比4%。

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圖片來源:每經(jīng)制圖

bioRxiv和medRxiv屬于預(yù)印本網(wǎng)站,均由大名鼎鼎的冷泉港實(shí)驗(yàn)室(The Cold Spring Harbor Laboratory,縮寫CSHL)創(chuàng)立。CSHL被稱為世界生命科學(xué)的圣地與分子生物學(xué)的搖籃,在該研究所一共誕生了8位諾貝爾獎得主。

預(yù)印本網(wǎng)站是儲存及發(fā)布醫(yī)學(xué)類學(xué)術(shù)論文的平臺,預(yù)印本指的是在同行評審前就公開分享的科研論文手稿。同行評審是現(xiàn)代學(xué)術(shù)交流的基石,被公認(rèn)為是科技期刊判別研究論文的科學(xué)價值和保障文章學(xué)術(shù)質(zhì)量的重要手段。

發(fā)表在預(yù)印本平臺的文章同時可以提交給學(xué)術(shù)期刊,經(jīng)過專業(yè)人員進(jìn)行相關(guān)學(xué)術(shù)及非學(xué)術(shù)審查(如抄襲、明顯錯誤等)后,便可作為正式文章發(fā)表。

跟預(yù)印本平臺不同,《柳葉刀》這類著名期刊就像是“精英俱樂部”,發(fā)稿要求自然也很高。按照慣例,在《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》發(fā)表論文,從提交到正式發(fā)布,至少需要兩周時間。

《柳葉刀》與《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》、《美國醫(yī)學(xué)期刊》(The Journal of the American Medical Association)和《英國醫(yī)學(xué)期刊》(British Medical Journal)并稱為歷史最悠久的四大綜合性醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)期刊之一。

根據(jù)2019年6月20日發(fā)布的2018年SCI學(xué)術(shù)期刊影響因子,《柳葉刀》排名第四,影響力因子為59.102,位于《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》之后,后者影響力因子為70.67。《美國醫(yī)學(xué)會雜志》以 51.273 的影響因子排名第九?!禢ature》排名第13位,影響因子為43.07。《英國醫(yī)學(xué)雜志》排名38位,影響因子為27.604。bioRxiv等預(yù)印本網(wǎng)站不屬于期刊,因此沒有影響因子。

SCI 外文期刊影響因子每年六月份由湯森路透(Thomson Reuters)旗下數(shù)據(jù)庫 Web of Science中的《期刊引用報(bào)告》(Journal Citation Reports)發(fā)布。期刊的影響因子,指的是該刊前兩年發(fā)表的文獻(xiàn)在當(dāng)前年的平均被引用次數(shù)。一種刊物的影響因子越高,也即其刊載的文獻(xiàn)被引用率越高,一方面說明這些文獻(xiàn)報(bào)道的研究成果影響力大,另一方面也反映該刊物的學(xué)術(shù)水平高。

研究文章一旦在期刊上登載出來,就屬于“完成時”,原則上除了允許對個別文字進(jìn)行刊誤外,文本內(nèi)容和數(shù)據(jù)是不能更改的。預(yù)印本則處于可以被不停修改其內(nèi)容和數(shù)據(jù)的“進(jìn)行時”發(fā)布狀態(tài),在期刊正式接受文章之前,作者可以隨時通過點(diǎn)擊作者區(qū)域內(nèi)的“提交修訂”來提交文章的修訂版本,就如同計(jì)算機(jī)程序一樣,從初稿發(fā)表之日起可以被陸續(xù)“迭代”更為完善的版本。

“在開放的科學(xué)平臺上,應(yīng)該更多地共享研究成果,而不必等待出版。澳洲皇家病理科醫(yī)學(xué)院榮授院士、香港大學(xué)病理學(xué)系臨床醫(yī)學(xué)教授黎國思(John M Nicholls)向《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者說道。黎國思教授曾在《柳葉刀》期刊發(fā)表有關(guān)SARS的解剖病理學(xué)研究論文。

為促進(jìn)學(xué)術(shù)交流,加快科研成果傳播,權(quán)威學(xué)術(shù)期刊如《自然》也發(fā)布了明確的預(yù)印本政策。“自新型冠狀病毒暴發(fā)以來,我們便要求作者在向我們期刊提交與此次疫情相關(guān)的稿件時,盡可能快速和廣泛地分享期中和最終的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)集,包括與公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu)、研究機(jī)構(gòu)及世界衛(wèi)生組織進(jìn)行分享,并將論文稿件存儲在預(yù)印本服務(wù)器上。”《自然》總編輯斯凱珀向《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者解釋道。

世衛(wèi)組織:科研成果助力抗疫

中國科學(xué)院院士趙國屏在接受媒體采訪時曾表示,在一個新型流行病暴發(fā)的初期,很多論文是預(yù)防醫(yī)學(xué)的流行病學(xué)總結(jié)或臨床醫(yī)學(xué)的病例總結(jié)。這對實(shí)時實(shí)地的疾病防控與診治有直接的指導(dǎo)或參考價值,是非常需要及時開展交流的。

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圖片來源:攝圖網(wǎng)

“新的科研成果以及在SARS和MERS等疫情中積累的知識和經(jīng)驗(yàn),為抗擊疫情提供了支持。中國是疫情暴發(fā)的中心,因此,來自中國科學(xué)家的科研報(bào)告將是無價的。”世界衛(wèi)生組織在接受《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者采訪時說道。

1月30日,世界衛(wèi)生組織將新冠疫情列為國際關(guān)注的突發(fā)公共衛(wèi)生事件。在疫情趨勢越發(fā)嚴(yán)峻的情況下,為了打贏這場“抗疫戰(zhàn)“,如何保障新冠病毒的信息能夠通暢、快速共享,是對抗疫情的努力中不可缺少的一部分。

“信息是疫情防控的關(guān)鍵,”2月1日,《柳葉刀》在一篇評論文章中肯定了科學(xué)研究在公共衛(wèi)生應(yīng)對措施中的重要地位,“中國科學(xué)界反應(yīng)迅速,實(shí)時調(diào)查和報(bào)告疫情,提供重要的公共衛(wèi)生、臨床和病毒學(xué)數(shù)據(jù)來指導(dǎo)中國和全球應(yīng)對疫情。”

以解剖病理研究為例。2月17日,《柳葉刀》發(fā)表了首份新冠肺炎病理學(xué)報(bào)告,研究團(tuán)隊(duì)來自解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學(xué)中心。該研究基于患者死亡后的微創(chuàng)病理檢查,結(jié)果顯示,新冠肺炎的病理特征與SARS和MERS非常相似。

“這意味著,新冠病毒與SARS和MERS病毒有相同的攻擊目標(biāo),即用于氣體交換的肺泡細(xì)胞。新冠病毒致死的主要原因是肺部損傷,但更重要的是弄清死因到底是病毒引起的主要損害,還是機(jī)體對病毒的過度反應(yīng)引起的變化(如彌漫性肺泡損害),亦或是使用類固醇引起的繼發(fā)性細(xì)菌感染,”黎國思(John M Nicholls)教授告訴《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者。

這對于病毒檢測和新冠肺炎的臨床治療具有十分重要的意義。“如果損害是由機(jī)體對病毒的反應(yīng)引起的,這將影響治療的選擇,“黎教授解釋道。

“進(jìn)行病毒培養(yǎng)也是很重要的一步,可以觀察到病毒在體內(nèi)存在多長時間、患者是否產(chǎn)生相應(yīng)的抗體,”他進(jìn)一步表示,“如果在解剖時(假設(shè)生病后7天)未發(fā)現(xiàn)有殘留活性病毒,則意味著在臨床治療中對生病超過7天的患者不必使用抗病毒藥物。“

與此同時,有關(guān)新冠病毒的病毒學(xué)研究也為疫苗的研發(fā)奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

2月10日,澳大利亞新南威爾士州的研究人員宣布成功培養(yǎng)出基于患者病毒樣本的活病毒,且已經(jīng)能夠構(gòu)建該病毒的兩個完整基因組序列。在新南威爾士州衛(wèi)生部公共衛(wèi)生病理學(xué)主任多米尼克•德威爾(Dominic Dwyer)看來,這除了能幫助進(jìn)行病毒測試外,還能推進(jìn)疫苗研發(fā)。

2月19日,知名學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》發(fā)表了一篇論文,來自美國得克薩斯大學(xué)奧斯汀分校的McLellan實(shí)驗(yàn)室團(tuán)隊(duì)首次利用冷凍電鏡展示了新冠病毒刺突蛋白的3D分子結(jié)構(gòu),再度確認(rèn)刺突蛋白結(jié)構(gòu)是疫苗應(yīng)對的關(guān)鍵區(qū)域。

“知道了病毒背后的機(jī)制就能更好地指導(dǎo)疫苗研發(fā)。”該實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)的分子生物學(xué)博士Wang Nianshuang告訴《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者。“我們正在使用一種稱為‘基于結(jié)構(gòu)的疫苗設(shè)計(jì)’方案來研發(fā)更好的疫苗?,F(xiàn)在已經(jīng)獲得了性能良好的新冠病毒刺突蛋白和3D結(jié)構(gòu),基于這個結(jié)構(gòu)可以進(jìn)一步設(shè)計(jì)和改造該刺突蛋白以取得品質(zhì)更優(yōu)的疫苗。”Wang Nianshuang博士也是該論文的主要作者之一。

紐約大學(xué)生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)教授卡羅爾•肖克斯•賴斯(Carol Shoshkes Reiss)也對記者表示,“科研透明性有助于全世界的科學(xué)家和臨床醫(yī)生了解新冠病毒以對抗疫情。

事實(shí)上,新冠病毒肺炎研究進(jìn)行至今,全球科學(xué)家都在竭盡全力探尋這一新型病毒的真實(shí)面貌和應(yīng)對疫情的有效手段。越是在這種緊要關(guān)頭,傳遞正確的信息越是馬虎不得。

在國際頂級醫(yī)學(xué)期刊《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》于2月27日發(fā)表的一份音頻文件中,該雜志執(zhí)行主編斯蒂芬•莫里西(Stephen Morrissey)就認(rèn)為,如果并未處于衛(wèi)生緊急事件且時間充裕的情況下,嚴(yán)格審閱、編輯論文非常重要,這樣才能確保醫(yī)生和公眾看到的信息是可靠的,而遇到新冠肺炎的緊急情況,需要要加快速度。“但是,我們不可能做到每一篇論文都能如此之快。”

在該雜志責(zé)任編輯林賽•巴登(Lindsey Baden)博士看來,在緊張的氛圍當(dāng)中,如何傳遞正確的信息非常重要。他認(rèn)為,當(dāng)前很多心懷善意的科研者做出了許多觀察報(bào)告,但是并不是所有的都是正確的。“當(dāng)前我們都很擔(dān)心疫情,這意味著我們更要非常小心地傳達(dá)信息,以公平和平衡的方式幫助公眾了解實(shí)情。需要相當(dāng)多的努力才能找到最佳的速度和平衡。”

莫里西博士鼓勵論文作者及時跟當(dāng)?shù)氐男l(wèi)生部門分享他們的信息,還可以先在預(yù)印本網(wǎng)站發(fā)表他們的發(fā)現(xiàn)。“《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》也會加快審閱和發(fā)布的速度。”他補(bǔ)充道。

記者手記丨66天的139篇原創(chuàng)論文僅是新冠研究的開始

科普同樣任重道遠(yuǎn)

權(quán)威醫(yī)學(xué)期刊上刊載的外語論文因其大量的專業(yè)術(shù)語,復(fù)雜的計(jì)算模型,繁瑣的實(shí)驗(yàn)過程而顯得曲高和寡,然而一場疫情的到來讓這些期刊以及論文走進(jìn)了平常人家的生活,成為屢次占據(jù)社交媒體的話題詞。借由媒體、意見領(lǐng)袖的傳播,這些小眾的“期刊論文”開始展現(xiàn)科普力量,當(dāng)家人轉(zhuǎn)發(fā)了一篇《柳葉刀》刊載的新冠研究成果給我時,那一刻感覺朋友圈養(yǎng)生文好像已戰(zhàn)敗,科普時代已到來。

然而當(dāng)疫情發(fā)展的時間線,封城后武漢推行各項(xiàng)措施的時間線在讀者中廣為流傳之時,對新冠病毒肺炎科學(xué)研究發(fā)展的時間線卻未見蹤影。同時,那些質(zhì)疑研究者在疫情蔓延期間搶發(fā)論文的聲音并未消停。

在梳理這篇報(bào)道的材料時,那些生僻的外文詞匯帶來了巨大的閱讀障礙,讓我們?nèi)龓孜挥浾邘状卧谏钜箷r分感到崩潰。可是當(dāng)我們走進(jìn)這些論文后,當(dāng)連線這些期刊或者背后的發(fā)文團(tuán)隊(duì)后,當(dāng)我們將科學(xué)研究與疫情發(fā)展加以聯(lián)系后,深知這場抗疫之戰(zhàn)最終勝利的軍功章上一定有這些科學(xué)家的名字。多位科學(xué)家告訴記者,疫苗研究正晝夜不歇地進(jìn)行中,現(xiàn)在還僅是開始。

記者:蘭素英  余佩穎  文巧  張凌霄

編輯:蘭素英

視覺:蔡沛君

排版:蘭素英 盧祥勇

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