據(jù)國家衛(wèi)健委，北京市新冠肺炎聚集性疫情發(fā)生后，國家衛(wèi)生健康委迅速行動，指導(dǎo)北京市做好疫情防控相關(guān)工作。6月11日開始，國家衛(wèi)生健康委黨組書記、主任馬曉偉多次主持召開專題會議，研究部署北京新冠肺炎聚集性疫情防控相關(guān)工作，向北京派出專家組指導(dǎo)防控工作，并對在京委屬委管醫(yī)院和全國面上進一步加強防控工作進行部署。

專題會議指出，習(xí)近平總書記對新冠肺炎疫情防控多次做出重要指示批示，李克強總理、王滬寧同志、孫春蘭副總理等中央領(lǐng)導(dǎo)同志對北京市近日出現(xiàn)的新冠肺炎聚集性疫情防控工作提出明確要求。孫春蘭副總理先后召開專題會議、國務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機制會議研究部署疫情防控工作。要認(rèn)真貫徹落實中央領(lǐng)導(dǎo)同志批示指示要求，按照孫春蘭副總理主持召開會議部署，確保各項防控措施一以貫之落實到位，堅決防止疫情擴散蔓延。目前疫情防控形勢依然十分嚴(yán)峻，疫情防控工作仍然存在不確定性。要強化底線思維和擔(dān)當(dāng)意識，立足防大疫、打大仗，從防與治兩端發(fā)力，以堅決果斷、有力有效的舉措，將疫情扼殺于成災(zāi)之前。要切實落實“外防輸入、內(nèi)防反彈”的防控策略，健全及時發(fā)現(xiàn)、快速處置、精準(zhǔn)管控、有效救治的常態(tài)化防控工作，盡快查清傳染源，有效阻斷傳播途徑，堅決遏制疫情蔓延擴散。

國家衛(wèi)生健康委已經(jīng)向北京派出委領(lǐng)導(dǎo)擔(dān)任組長的專家組指導(dǎo)防控工作，加強疫情形勢分析研判，有針對性地做好防控工作，并抽調(diào)有武漢工作經(jīng)驗的防治專家，尤其是流行病學(xué)調(diào)查、環(huán)境消殺等方面的國家專家參加北京市相關(guān)工作。根據(jù)北京當(dāng)前疫情情況對北京市防控工作提出“四個擴大”、“四個加強”和“四早”等明確要求。擴大北京市新發(fā)地等農(nóng)貿(mào)市場的環(huán)境和物品采樣，擴大對北京市重點區(qū)域、重點人群的核酸檢測，擴大對病例密切接觸者、次密切接觸者的流行病學(xué)調(diào)查，擴大相關(guān)人員的隔離醫(yī)學(xué)觀察范圍。加強醫(yī)療機構(gòu)發(fā)熱門診排查管理，加強醫(yī)院感染控制，加強疫情信息報告和發(fā)布，加強公眾宣傳教育。早發(fā)現(xiàn)、早報告、早隔離、早治療，切實落實病例2小時進行網(wǎng)絡(luò)直報，12小時反饋實驗室檢測結(jié)果，24小時完成流行病學(xué)調(diào)查。同時，組織專家定期發(fā)布權(quán)威信息，解疑釋惑。

6月13日，國家衛(wèi)生健康委召開在京委屬委管醫(yī)院工作會，部署加強預(yù)檢分診和發(fā)熱門診管理、醫(yī)院感染控制、核酸檢測等防控措施，全力配合支持北京市做好疫情防控工作。同時，印發(fā)通知，部署各地進一步加強全國面上防控工作，做好相關(guān)人員追蹤隔離、組織對海鮮市場大排查，加強醫(yī)療機構(gòu)發(fā)熱門診排查、相關(guān)人群核酸檢測等疫情監(jiān)測工作，加強農(nóng)貿(mào)市場相關(guān)環(huán)境、物品采樣檢測和環(huán)境消毒工作等防控措施提出明確要求。